Git diff もpatchコマンドで扱う形式に変換できます。
通常のgit diffと併せて、"–no-prefix"のオプションを使います。
このオプションは
”--no-prefix”
Do not show any source or destination prefix.
とあるように、ファイル名のような情報を表示しないオプションです。
$ git diff --no-prefix > patchfile.diff
パッチファイルを適用するには、p0オプション（ディレクトリの差がない）をつけて
$ patch -p0 < patchfile.diff
とやってあげれば良いです。
