Arduino IDEにデフォルトで存在しないボードを追加する。

Arduino IDEには公式がサポートしているAVR系の石を採用したボードが一通り把握されています。

ARM系*1Intel*2はデフォルトではリストにありません。
これらはボードマネージャで明示的に入れてあげる必要があります。

実際のところ

32bit ARMが乗ってるMegaっぽいボード、Arduino DueをOS X環境に入れるケースを考えます。

ツール」=>「マイコンボード」=>「ボードマネージャ」と進むと以下の様な画面が出ます。
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検索画面で「due」とやると、結果が一つに絞りこまれます。
バージョンはとりあえず最新にしておけば問題ないでしょう。
インストールボタンを押すと、ダウンロードが始まります。
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無事に追加されると、ボード種別の中にArduino Dueが追加されます。
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参考もと

Arduino - Cores

*1:Due,MK1000,Zero

*2:101,Galileo,Edison