imagemagickである程度連続した画像を横に繋げる簡単な方法としてsmushオプションがあります。
実際のところ
プラスだと横、マイナスだと縦
引数をつけて多少オーバーラップさせることも可能
$ convert rose: rose: +smush -10 sixel:
gimpを使う方法もあるらしい
とはいえ、この方法だと歪みやズレはどうにもなりません。
この場合、画像処理ソフトの有名ドコロgimpのプラグインが目的を達成するいい方法になるやもしれません。
Pandora: a GIMP Plugin for Making Panoramas
Hugin - Panorama photo stitcher